Båtsfjord Havn er Båtsfjord kommunes havnefaglige organ, og skal ivareta de administrative og forvaltningsmessige oppgaver Båtsfjord kommune er tillagt etter havne- og farvannsloven, og bestemmelser gitt i medhold av denne loven. Båtsfjord Havn skal sørge for en rasjonell og effektiv havnedrift, føre tilsyn med trafikken i båtsfjord kommunes havnedistrikt og forvalte Båtsfjord havnekasses eiendommer, innretninger og andre aktiva med sikte på en best mulig ressursutnyttelse for havnens brukere og kommunen. For å opprettholde og videreutvikle havnenes trafikkgrunnlag, kan Båtsfjord Havn engasjere seg i havnetilknyttet virksomhet når dette er fordelaktig og hensiktsmessig for Båtsfjord kommunes havnevirksomhet.